农业硕士是2017年批准设立的专业学位硕士点，主要为农艺与种业领域技术研究、应用、开发及推广，农村发展和农业教育等企事业单位和管理部门培养应用型、复合型高层次人才。

该专业硕士点拥有一支实力较强的师资队伍。具有专任教师29名，国家级、市级人才12名，上海市农委体系专家3名。聘请国家与上海农学领域兼职行业教师15人。在蔬菜与水稻分子育种、天然活性物质提取与利用、农产品保鲜与安全检测等方向有明显的优势和特色。

近五年，已培育水稻新品种或品系35个（4个获农业部授权），菠菜新品种3个，获授权专利107项。发表论文358篇，其中SCI收录203篇。承担“973”课题、国家基金重点等科研项目138项。获国家科技进步二等奖1项，上海市科学技术一等奖和三等奖各1项。

该专业硕士点设三个研究方向：

1. 园艺科学：主要研究蔬菜品种选育、野生种质资源利用、园艺植物抗逆机理、都市观赏园艺，以及植物病虫害防治等。

2. 作物科学：主要研究作物重要农艺性状功能基因发掘、水稻分子育种、功能性稻米种质创制，以及水稻光敏核不育机理等。

3. 天然产物利用：主要研究植物活性物质提取与利用、农产品加工新技术、食品质量安全控制技术、农产品保鲜与安全检测技术等。