遗传学是生命科学的核心学科。遗传学硕士点创立于1996 年。近5年来，本学科承担有多项国家及省部级的科研项目和人才项目，包括国家重点研发计划、科技部重大基础研究专项、国家生物转基因研究专项、国家948重大项目、国家自然科学基金重大项目、国家自然科学基金杰出青年基金项目、国家自然科学基金优秀青年基金项目、国家自然科学基金面上项目、教育部优秀青年教师计划和国家留学归国基金项目、国家航天育种重大工程、上海市科委重大和重点项目、上海市自然科学基金项目、上海市教委重点项目以及上海市农委重大科技攻关项目、教育部新世纪人才计划、上海市浦江人才计划、上海市启明星计划等。近来相关成果发表在Science、Cell、Nature Genetics、Nature Communications、PNAS、The Plant Cell、Plant Journal、New Phytologist、Plant Biotechnology Journal、Plant Physiology、Plant Science、Plant Biology、Rice 等国际顶级学术期刊上。
毕业的研究生具有很好的就业前景及深造机会。除了继续选择攻读博士学位和国外留学之外，毕业生大多在上海市及长三角地区的高、中等院校、科研院所从事教学、科研、管理、研发等工作。
目前遗传学硕士点设有7个研究方向：
（1）作物群体遗传学: 利用计算生物学方法，进行作物群体遗传学分析和复杂农艺性状的遗传基础解析。
（2）植物免疫及抗病机制研究：综合利用遗传学、分子生物学、生物化学等手段研究植物免疫信号传导及抗病分子机制，并开展植物抗病基因工程研究。
（3）玉米功能基因组学与籽粒遗传改良：利用遗传学和多组学手段解析玉米蛋白品质形成的分子机制，为创造优质蛋白玉米的分子设计遗传育种奠定基础。
（4）水稻功能基因克隆和分子育种：利用基因编辑技术、转基因技术和分子育种等技术分子克隆水稻功能基因以及创制与培育优质特色功能水稻新品种。
（5）植物天然产物代谢调控与代谢工程：围绕药用植物天然产物的代谢调控和合成生物学，解析植物代谢途径，改造代谢通路，提高重要天然产物的产量，并降低植物有效成分的生产成本。
（6）水稻及其农作物优质性状基因挖掘：利用分子遗传学与基因工程方法，开展分子标记育种技术的研发与推广；
（7）基因编辑技术与微生物：植物基因编辑新系统的研发以及利用CRISPR/Cas9 技术改造稻米胚乳成分，创制特有营养品质水稻新种质。
